杏仁核（英语：Amygdala）又名杏仁体，位于侧脑室下角前端的上方，海马体旁回沟的外侧，顶部与与尾状核的末端相连。杏仁核是边缘系统的皮质下中枢，有调节内脏活动和产生情绪的功能。引发应急反应，让动物能够挺身而战或是逃离危险。杏仁核体积不大，但对情绪反应十分重要，尤其是恐惧。当动物个体遭遇伤害性刺激，大脑杏仁核的特定区域会“因为学会害怕”，从而产生恐惧的记忆。杏仁核可以产生情绪激励，从而增强记忆。会让人注意到该次经验中最重要的细节。如：被抢的人通常会记得到犯人持用的刀械，而杏仁核受伤的人就不能记得这些细节。杏仁核判断所看见的物体在情绪上的重要性：那是猎物，是天敌，是配偶，还是完全无关紧要的东西。如果杏仁核变得兴奋，那么说明眼前的东西很重要，神经信号就会向下发送到自主神经系统，心跳开始加速，手掌开始出汗（导致皮肤电阻改变），肌肉开始收缩。如果杏仁核判断看到的是无关紧要的东西，身体就没有上述反应。压力靠着“释放肾上腺素”和“释放糖皮质素”来强化学习。这两种激素都会作用在杏仁核和海马体的受体上，以增强突触可塑性；但长期的慢性压力反而会大大损害学习能力。从不同角度看杏仁核的位置（红色为杏仁核）动画。杏仁核是杏仁状的暗红色。穹窿，丘脑，乳头体，苍白球，壳核，尾状核，海马回。