萨米人遗传学是遗传学中专门以萨米人为研究对象的学科。居住在北欧的萨米人与其他欧洲人在遗传学上有很大差别，因而引起了遗传学家们的浓厚兴趣。目前研究的重点是女性线粒体DNA，另外也有关于Y染色体以及传统的常染色体标记。