杨崇伊（1850年－1909年），字莘伯，江苏省苏州府常熟县人。清朝政治人物、进士出身。

光绪六年（1880年）庚辰进士，同年五月，改翰林院庶吉士。光绪九年四月，散馆，授翰林院编修。光绪二十一年（1895年）考授广西道监察御史，到任第一疏即弹劾康有为、梁启超在京师创设强学会，导致朝廷将其封禁。光绪二十二年（1896年）又纠内阁侍读学士文廷式。光绪二十四年（1898年），杨崇伊密奏慈禧太后：“风闻东洋故相伊藤博文，将专政柄。伊藤果用，则祖宗所传之天下，不啻拱手让人。”光绪三十四年（1908年）八月，丁忧回籍，寄寓扬州，因争抢妓女，被江苏布政使瑞澄参劾，逐回原籍，交地方官严加管束。后来，杨崇伊之子杨云史为父平反，正值光绪、慈禧先后逝世，事被搁置，最后于民国十一年为杨崇伊平反，并颁发“含谟吐忠”的祠额。杨家在得到祠额后，重新建造新杨家祠堂，该祠堂直至一九九五年才被常熟地方拆除。