基因连锁群（linkage group），位于一个染色体上的所有基因。但个体基因连锁群的数目和染色体的对数相等。例如果蝇的染色体有四对，基因连锁群的数目即为4，因为要由共轭的一对基因控制同一种性状。

基因连锁群在遗传的过程中会作为整体传到下一代，而不实现孟德尔独立分配定律。

例如人类红绿色盲，红色盲和绿色盲基因都位于X染色体上，它们会同时传给下一代。而病人会同时患上两种色盲。