截至2015年8月，中华人民共和国教育部直属高等学校共有75所。

说明：

根据中央教育科学研究所高等教育研究中心2009年12月发布的《中国高等学校绩效评价报告》，在教育部直属72所高校中（中央美术学院、中央戏剧学院和中央音乐学院未纳入排序），近半数的高校过去三年（2006年－2008年）的产出低于投入，另外29所“产出高于投入”，7所“投入产出相当”。

另有批评指，教育部直属高校在学校领导任命、内部管理、与其它普通高校竞争等方面行政化、官僚化问题严重，且凭借与教育部的隶属关系比其它高校容易获得更多的教育资源。