日本的自然环境保全地域是基于自然环境保全法，针对需要特别保护的自然环境而指定的区域。此外，也有基于同一法律所指定的原生自然环境保全地域（环境大臣指定）和都道府县自然环境保全地域（都道府县的知事指定）。

根据日本自然环境保全法（管理单位为环境省），首先区分为自然环境保全地域、都道府县自然环境保全地域和原生自然环境保全地域。接下来，自然环境保全地域、都道府县自然环境保全地域又更进一步的分为特别地区、海域特别地区和普通地区。

自然环境保全地域是单纯为了保护自然环境，而自然公园的目的则是为了在保护的同时促进该地区的利用（例如观光等）。

以下的规范和限制主要是针对自然环境保全地域。都道府县的自然环境保全地域，由各都道府县的自定条例来规范。

虽然是报备制，但受理的官方单位也有可能限制或禁止申请者的行为。这是自然公园法（普通地区）、自然环境保全法（普通地区）的特征之一。

环境大臣所指定的地区。