虫黄藻 （Zooxanthella；复数Zooxanthellae，发音为/ˌzoʊ.əzænˈθɛliː/）是海藻的一种，是多种海洋动物和原生动物内的一种一种金黄色细胞间共生菌，特别是珊瑚纲生物，如石珊瑚和热带海葵等常见。虫黄藻大多数都是自养生物，并会为宿主提供易位式还原碳化物，如：葡萄糖、甘油、氨基酸等光合作用的产物 。 虫黄藻可以为珊瑚礁提供高达90％的能源需求。 作为回报，珊瑚为虫黄藻提供保护、居所、营养（主要是含有氮和磷的废料）和恒定供应光合作用所需的二氧化碳。 透过对养分、光线及对过剩细胞的驱逐，珊瑚可以控制虫黄藻的数量，以免其过度繁殖，这个动作称为排出共生藻，而周围的珊瑚有些会继续接受他们。 虫黄藻亦有在其他原生动物（例如：foraminiferans和放射虫）和一些无脊椎动物里居住。

造礁珊瑚对虫黄藻非常倚赖，使珊瑚被限制于只能在透光区内生长。