驻日盟军总司令（日语：連合国軍最高司令官総司令部／れんごうこくぐんさいこうしれいかんそうしれいぶ Rengō kokugun saikō shirei-kan sō shirei-bu；英语：Supreme Commander of the Allied Powers，缩写SCAP），又译为盟军最高司令官总司令部、盟军最高司令部，简称盟总或盟总政府，日本又称总司令部（英语：General Headquarters，缩写GHQ；当中“GHQ”头衔被日本政界与民间广泛使用），是美国远东军（英语：United States Army Forces in the Far East）司令兼驻日美军总司令麦克阿瑟元帅在日本盟军占领时期期间的一个头衔，1951年由李奇微将军接任。1952年，旧金山条约签订，日本恢复主权（日语：主権回復の日），此职取消。

在第二次世界大战的太平洋战争结束后，为执行美国政府“单独占领日本”的政策，麦克阿瑟将军以“驻日盟军总司令”名义在日本东京都建立盟军最高司令官总司令部，日本人称之为“总司令部”，即“General Headquarters”，即“GHQ”。“SCAP”这一头衔只有麦克阿瑟将军担任过。

随着日本宣布无条件投降，二战正式终止。根据《波茨坦宣言》，盟军（事实上只有美军）于日本建立进行接管的总司令部掌管日本的军事占领，而英联邦占领军（英语：British Commonwealth Occupation Force）则进行中国地方和四国地方的占领任务。1945年8月28日，第一批盟军于横滨登陆，并设立盟军最高司令官总司令部；1945年8月30日，盟军最高司令官麦克阿瑟也搭机抵达日本。1945年9月2日，日本正式签署《降伏文书》。随后到1952年4月28日期间，盟军最高司令官总司令部透过日本国政府实行所谓“间接统治”，主要大权均操在盟军最高司令官总司令部手中。

1951年4月16日，麦克阿瑟与盟军最高司令官总司令部民政局局长考特尼·惠特尼返回美国，马修·李奇微接任盟军最高司令官。1952年4月28日，《旧金山和约》生效，盟军最高司令官总司令部结束占领日本，日本恢复主权国家地位；但是冲绳诸岛等领土则迟至1972年才移交给日本。