电影《神奇动物在哪里》的原声带于2016年11月18日由水塔音乐（英语：WaterTower Music）发行，作曲者为詹姆斯·纽顿·霍华德。

2016年4月，宣布将由詹姆斯·纽顿·霍华德谱写《神奇动物在哪里》的配乐。霍华共花了七个月的时间来谱写配乐。Pottermore网站于同年10月发布首支官方主题曲。有部分沿用约翰·威廉斯为哈利·波特电影谱写的“海德薇主题”，但也加入了新写的主题。

配乐中的歌曲“Blind Pig”由J·K·罗琳亲自撰写歌词，澳洲歌手Emmi（英语：Emmi (Australian singer)）演唱。