在分子生物学中，摇摆碱基对（英语：Wobble base pair）为一对华森，克立克碱基对例外的双核苷RNA分子。四个主要摆动碱基鸟嘌呤-脲嘧啶(guanine-uracil)，肌苷-脲嘧啶(inosine-uracil)，肌苷-腺嘌呤(inosine-adenine)和肌苷-胞嘧啶(inosine-cytosine)(以上各简称为GU, IU, IA and IC)。就热力学来说，摇摆咸基对的稳定性与华森-克立克碱基对约略相等。摇摆碱基对为RNA二级结构的基础，对于遗传密码转译的正确性至关重要。

弗朗西斯·克里克(Francis Crick)提出"tRNA5"端的第一个反密码子与信使RNA的第三个碱基结合，比起其他的两个反密码子，它的定义比较没有这么严格"也就是说tRNA的第一个反密码子比起其他两个反密码子，有较松散的定义。 在华森，克立克所订立出的理论理，A要配对上T，但是在第一个反密码子也可以出现A配U等等情况。