布拉格查理大学（捷克语：Univerzita Karlova v Praze；拉丁语：Universitas Carolina in Prague；英语：Charles University in Prague；德语：Karls-Universität Prag）成立于1348年，是捷克乃至中欧最古老的大学，也是捷克最大的大学。
布拉格大学是欧洲顶尖大学科英布拉集团、欧洲大学联盟以及Europaeum成员。布拉格大学在历史上诞生过很多著名学者和科学家。像第谷·布拉赫，约翰内斯·开普勒，伯纳德·博尔扎诺，恩斯特·马赫和阿尔伯特·爱因斯坦等都曾在此探索到他们的发现。布拉格大学的学生和教授在历史上诞生过四位诺贝尔奖获得者。 它已发展成了一所综合性的世界闻名的高等学府，现有五万余名学生在此就读。
1348年，神圣罗马帝国皇帝查理四世（也兼任波希米亚国王称查理一世）创办了这所大学，一开始就将它命名为“查理大学”（此后的布拉格是神圣罗马帝国的首都）。
查理大学始建于1348年波希米亚国王和神圣罗马皇帝查理四世统治时期，是阿尔卑斯山以北和巴黎以东的第一所大学。以博洛尼亚大学和巴黎大学为模型，最初它有四个学院：神学院、文学院、法学院和医学院。在查理之子温塞斯拉斯四世的领导下，捷克学术界的地位得到了加强。
该大学在胡斯改革运动中进行了改造。宗教改革家扬·胡斯当时是这所大学的校长。在随后的社会和政治革命中，该大学被缩减为一个学院——文学院，成为后来的宗教改革学院的原型。
哈布斯堡皇帝鲁道夫二世把布拉格变成了一个文化大都市，大学与宫廷并驾齐驱。
17世纪初，大学参与反哈布斯堡王朝运动和三十年战争。战争的结果使这所大学成为查理-费迪南德大学的一部分(这个名字一直延续到1918年捷克斯洛伐克成立)。所有四个前胡斯学院都恢复了，大学被改造成一所国家管理的教育机构。这一进程在1780年代随着约瑟夫二世皇帝的改革而达到高潮。
1848-49年改革后，大学开始采用现代高等教育机构的形式。1882年，在捷克民族复兴的高潮，
布拉格的查理-费迪南德大学被分为两个机构：捷克语查理大学和德语查理大学（Karls-Universität Prag）。到20世纪之交，两所大学都达到了很高的学术水平。德语查理大学教授之一是理论物理学家阿尔伯特·爱因斯坦。捷克语查理大学教授包括在民族解放进程中发挥突出作用的伟人，其中最引人注目的是1918年成为捷克斯洛伐克首任总统的托马斯·马萨里克。
1918年第一次世界大战结束，奥匈帝国解体，捷克斯洛伐克成立，查理-费迪南德大学不复存在。查理大学（Univerzita Karlova v Praze）是独立后捷克语大学的名字，它取得了与世界上最负盛名的学术和研究机构相媲美的成果。一个值得注意的例子是雅罗斯拉夫·海罗夫斯基教授在极谱方面的发明，于1959年被授予诺贝尔奖。
希特勒吞并捷克带来了巨大损失。1939年11月17日，捷克所有高等教育机构因1939年10月28日的学生示威和医科学生Jan Opletal的葬礼而关闭。随后，学生和教师受到广泛迫害。查理大学直到第二次世界
大战后才恢复活动。随着纳粹德国统治的结束，德语查理大学也不复存在，该大学于1939年加入德意志帝国大学联盟。
1948年政变中断了查理大学学术自由的复兴。当局长期对教研进行严格的思想政治控制，对国际交流和学术研究产生负面影响。1989年11月17日，忠于其学术自由传统的学生举行示威，反对极权政权，最终致其垮台。
1990年代以来，大学蓬勃发展，并大力促进国际合作。查理大学意识到其使命，继续促进学术合作，并在广泛的欧洲和全球议程中发挥积极作用。
查理大学包含17个学院，分布在布拉格、比尔森和赫拉德茨-克拉洛韦：
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