在版本控制与软件配置管理中，分支（英语：Branching）是由某个版本的程式码或软件物件中建立复制版本，在分支出来后的两个版本，可以独立进行修改。

分支会形成树状结构，也被称为trees，streams或codelines。原始的版本，称为父分支（parent branch）或是上游分支（upstream branch）。分支出来的复本，称为子分支（Child branches）。作为最源头，没有父分支的分支，称为主干（trunk）或主线（mainline）。

在分散式版本控制系统（例如Darcs（英语：Darcs））中，分支和存放版本的仓库（repository）是一样的。在这类系统，复制一份仓库的复本和分支是一样的。

软件进行分支后，之后有可能会再将分支合并回父分支。常见的是将修改内容合并回主干（有可能主干不是父分支）。若某个分支不打算合并（例如曾由第三方授权，授权内容不相容，因此已重新授权（英语：relicensing），或是用在不同用途上），会称为分叉（fork）。

建立分支可以让各部分的程式码可以平行开发。大型专案会有不同的参与者，例如开发人员、build管理者，以及软件质量保证人员等。甚至需要维护针对不同操作系统的不同发行版。分支可以让参与者在不破坏基础代码稳定性的情形下，将修改和基础代码隔离，再进行程式错误修正、新机能（英语：Feature (software design)）开发、软件版本整合等。这些修改可以在测试完成后，再合并回主线。

开发分支（development branch）或开发树（development tree）的程式码是指正在软件开发，但还没有正式发行的程式码。若在开放源代码社群中，“正式发行”不是那么直觉，因为任何人随时都可以取出（check out）需要的版本，不管是不是在开发分支中都可以取出。一般而言，最终会是下一个主要版本的分支就是开发分支。不过也常常同时开发多个机能，因此存在多个开发分支。

有些版本控制软件会针对主要的开发分支有特殊的命名，例如在CVS中称为MAIN，在Git中则称为master。

在cvc（英语：cvc system）（开源软件，整合rPath开发的版本控制系统）及CVSNT（英语：CVSNT）中，可以针对上游的分支建立阴影分支或魔术分支，在小修改的维护上比较方便。

在分散式版本控制中，可以复制整个仓库（以及其中的分支），之后再进行开发。Monotone（mtn）、Mercurial（hg）及Git称为clone。