Windows磁盘碎片整理程序是一个Microsoft Windows的程序，用来进行磁盘碎片整理。透过重新将文件排序，增加文件的连续性。它可以增加磁盘的读取速度（某些时候，更可以增加磁盘的可用空间）。磁盘碎片整理可以优化文件的读取和写入速度，因为磁头的位置变换次数少了。

自从1975年起，磁盘碎片整理己成为优化磁盘的一部分。除了赛门铁克和微软外，只有一少部分公司，将磁盘碎片整理软件，与优化磁盘工具分开出售。

但到MS-DOS 5，和Windows NT 4.0，这些操作系统都没有内置磁盘碎片整理程序。

到了MS-DOS 6.0，操作系统开始内置了Defrag这个磁盘碎片整理软件。微软公司从赛门铁克获得授权，在MS-DOS 6.0中加入免费使用的Defrag程序。从此之后，电脑用户就很少使用商业版本的Defrag，因为两者分别不大。

在Windows NT核心的操作系统中，都内置了一个名为Diskeeper磁盘碎片整理软件。它是从Diskeeper Corporation（前称Executive Software）授权过来使用，是一个简化的版本。

在Windows Vista中，增加了一个选项，用于调度磁盘碎片整理，而CPU优先权则较低。它用了一个新的算法，名为。这样，磁盘碎片整理程序可以持续重组。但当用户使用电脑时，工具可以自动用较少的资源，来进行磁盘碎片整理。另外，软件接口亦有所简化，颜色图表和进度显示器都被移除。另外，若果资料块大于64MB，将不会被重组。微软表示，重组大于64MB的文件，对性能并没有明显得益。最后，磁盘碎片整理程序并不需要一定数量的空间，去完成磁盘碎片整理的动作。在之前的版本中，磁盘需要有15%的空间，才能完成磁盘碎片整理。在命令提示符中，defrag.exe代表磁盘碎片整理程序，而在Windows Vista中，用户可以透过它，更有效控制磁盘碎片整理的进度。这个工具可以重组特定的分区，或者分析之，就像Windows XP中的版本。

现在，磁盘碎片整理程序由Microsoft's Core File Services（CFS）团队进行维护。而Windows Vista版本的磁盘碎片整理程序亦将会透过Windows Vista SP1更新，去支持Windows Server 2008中所作的改进。

从Windows Vista以不透明的方式改版后，程序改成 dfrgui.exe，Windows 8将名称改为、Windows 10则是(Optimize Drives)

Windows磁盘碎片整理程序的竞争对手包括Diskeeper，Vopt，mstDefrag和O&O Defrag，同时有采用GPL授权的JkDefrag。