国立环境研究所 (日语：国立環境研究所)成立于1974年，是日本环境研究的关键部门。

1971年7月机构成立，1971年11月国立环境研究所成立委员会，1974年3月国立环境研究所成立，1985年4月昭和天皇访问国立环境研究所，1990年7月重组以进行全全球环境研究，1990年10月全球环境研究中心成立，2001年1月环境署成为环境部并设立新部门:垃圾管理部。2001年4月被确立为独立行政法人。目前国立环境研究所由八个研究中心组成，每一个中心又细分成更多的部门，不同的部门负责它们所特长的专业。八个中心负责在八个不同的领域进行研究，开展与这些领域相关的项目。