河南医科大学前身是1928年在开封成立的河南大学医科，后改名河南大学医学院。1952年从河南大学独立，更名为河南医学院。1957年迁至郑州，1984年更名为河南医科大学，是以医学为主的省属重点高等医科院校。

2000年河医大同郑州大学、郑州工业大学合并成新的郑州大学。河医大成为郑州大学医学部。