黄其晟（？－17世纪），字仲晔，福建泉州府同安县人，明朝、南明政治人物。

黄其晟是万历四十三年（1615年）乙卯科举人，天启二年（1622年）成进士，曾经担任内阁中书、巡视东城监察御史，出为江西抚州府知府，历南昌府、桂林府知府，升广西南宁道副使，任内有德政。

永历帝继位，让黄其晟升任工部右侍郎；永历二年（1648年）正月，他和蔡世承一同出任兵部左侍郎及右侍郎，但未赴官。之后他跟随永历帝到缅甸，被清朝军队抓拿入狱六年，回乡后去世。