《二二八事件责任归属研究报告》是由二二八事件纪念基金会真相研究小组召集历史学者共同参与、历时年余而完成的文件，2006年第一版（ISBN 957-29362-1-2）。内容主要将二二八事件责任归属的“元凶”指向蒋介石，认为蒋介石指派国民革命军整编第21师师长刘雨卿率兵赴台湾镇压，展开屠杀和清乡的镇压工作，应负最大责任。而陈仪、柯远芬、彭孟缉等军政人员应负“次要责任”。其他如张慕陶、史宏熹、刘雨卿是镇压行动的共犯。而情治人员、半山仔、社会团体与媒体工作者、线民、告密者、构陷者等都有责任。

《二二八事件责任归属研究报告》版权页标示的工作人员如下，（）内为当时资料。

由于《二二八事件责任归属研究报告》将二二八事件“元凶”指向蒋介石，2006年蒋孝严对二二八事件纪念基金会董事长陈锦煌、中央研究院近代史研究所副研究员陈仪深和国史馆馆长兼真相研究小组召集人张炎宪提起刑事诉讼附带民事赔偿。中国国民党文化传播委员会党史馆主任邵铭煌表示，二二八事件相关研究应将蒋介石后续处理经过也列入，不能只是选择性引用资料。另外，中央研究院次级团体“二二八研究增补小组读书会”发表两年研究成果，对《二二八事件责任归属研究报告》提出反驳，并要求公开辩论。

《二二八事件责任归属研究报告》目前仅被视为一份部分学者之研究报告，不代表官方认定之事实。而其它学者的各种对二二八事件的研究仍在持续进行，其中朱浤源的70万页报告为目前对二二八事件最大型之研究成果。

2017年2月3日，二二八事件纪念基金会执行长杨振隆说，他与二二八事件纪念基金会董事长薛化元上任后将推动“二二八事件责任归属报告官方版”列为首要任务，《二二八事件责任归属研究报告》指称“蒋介石是事件元凶，应负最大责任”，但《二二八事件责任归属研究报告》因“现在只是行政院备查，不是官方版”而不能被教科书引用；他与薛化元在上任前拜访中华民国内政部部长叶俊荣，叶俊荣承诺愿意推动《二二八事件责任归属研究报告》列为官方版。2017年2月25日，台湾北社副社长李川信说，《二二八事件责任归属研究报告》已定义蒋介石是二二八事件元凶，如今已经过10年，他呼吁总统蔡英文，现在蔡英文政府完全执政，“若用总统身份定调‘元凶就是蒋介石’，民间绝对会支持你”。