吴邦辅，字元素，浙江承宣布政使司绍兴府山阴县（今浙江省绍兴市）人，明朝政治人物。

吴邦辅袭父吴孟明职，理北司刑。崇祯末年，给事中姜埰、行人司副熊开元以言事同日被下诏狱，崇祯帝欲处死两人，吴邦辅故意延缓。崇祯帝稍微解气后，令严讯主使者。邦辅乃上讯劝阻，诏改为杖百，二人因此免死。