海军大学校（日语：海軍大学校／かいぐんだいがっこう Kaigun Daigakkō ?）是旧日本海军内培养高等海军军官的一所学校。日语文献中有时可以缩略为“海大”。旧日本陆军系统内地位相当的学校为陆军大学校；战后日本海上自卫队对应的学校则为海上自卫队干部学校（日语：海上自衛隊幹部学校）。
1886年（明治19年）8月17日，时任海军大臣西乡从道下令设立“兵科与机械技术部军官及学生教育法调查委员（日语：将校竝機技士官及生徒教育法取調委員）”，对相关高等教育事宜进行先期调研。1887年西乡乘出访欧美之际也对各国教育制度进行了考察，并与英国海军大臣进行了一番长谈。最终日本方面聘用约翰·英格尔斯（日语：ジョン·イングルス）海军上校，开始筹备海军大学校的创办工作。
1888年（明治21年）7月16日，有关方面发布敕令第55号，规定了学校的官制等事项。同年8月28日在东京筑地的海军兵学校旧校馆开校办学（海军兵学校则搬迁至广岛江田岛（日语：江田島））。初代校长由军务局（日语：軍務局）局长井上良馨兼任，同年11月26日开始授课。
1893年（明治26年）11月29日，新修订的海军大学校条例规定新设军医科。1894年（明治27年）3月31日原海军医学校废止，同年4月1日共8名学生以海军大学校军医科学生的身份展开学业。但是因为医学的特殊性，合并后难以对医科生的学习课目和进度进行管理，因此1897年（明治30年）5月时任医务局长向西乡进行争取，希望重开军医学校。同年11月4日，海军大学校的医科部分剥离，重新设立新的海军军医学校，此后海军大学校不再包含医科。
1923年（大正12年）9月1日，学校设施在关东大地震中损毁严重，不过到同年12月末应急临时校舍就已经大体完工。1932年（昭和7年）8月27日，海军大学校搬迁到东京上大崎原陆军卫生材料厂旧址，同年9月1日开始在新校区开课。新校区的校舍叫做“厅舍”，并包含有兵棋推演场、科学实验场等大规模设施。
1945年5月，随着战争形势的发展，海军大学校也受到影响，职能停止了下来。日本战败后学校也一并废除，旧校址则交由1947年创办的国立预防卫生研究所（日语：国立感染症研究所）继续使用。研究所日后搬迁至他处，原址逐渐荒废，1999年拆除。
战后在广岛县设立的海上保安大学校继承了原海军大学校8000多册藏书。该图书馆现对公众开放，但需要事先向馆长提出申请方可入内进行阅览、复印等。
海军大学校内为培养海军兵科高级干部提供培训课程。学员的选拔范围为海军兵学校的毕业生、任职海军（兵科）军官并拥有实务经验的人员（通常要求至少1年）。获得考试资格者基本上为海军中坚力量的中低级军官如海军大尉、海军少佐等。大部分入校者的海军兵学校毕业排名（日语：卒業席次）都比较高，不过也有毕业排名比较低、但依靠自身努力获取入学资格的情况。
学校一般每年招收10-20名学生，九一八事变后开始每年招收约30人。中国抗日战争爆发后，也会有些年份完全没有招收新学员。
学生的具体划分类别时有变动。根据1901年的一本小册子的记载，学生分将校科甲种学生（学制两年）、将校科乙种学生（一年）、轮机科长期学生（日语：機関科長期学生，两年）、轮机科短期学生（一年）、选科学生（一年）。其中将校科甲种学生为部门长官从海军大尉中推荐，考试合格后入读；乙种学生为海军大尉根据需要专修某一科目；轮机科长期学生为从大机关士以及中机关士中间挑选有实务优秀、才华得到认可者；短期学生为从大机关士、中机关士乃至少机关士中挑选海军机关学校成绩佳者，经考试合格后入学研修高等学术；选科学生则为佐级军官、机关监以及实役暂停超过三年的海军大尉志愿入读。1944年的出版物则称学生分为甲种学生（两年）、还有轮机科学生（两年）、选科学生（一至四年）、特修学生（一年）等。
1903年（明治36年）颁行的《海军大学校教育纲领》里详细列明了各科目内容，包括：
具体的科目大纲随时间不同而时有增减调整。
一名日本海军军人想要在海军的官僚系统内出人头地的话，能从海军大学校毕业是一个重要的条件，但这个文凭并不像日本陆军那样是道硬性门槛。日本陆军军人只有从陆军大学校毕业才有可能爬到陆军中枢；相比之下，海军并不像陆军那样那么强调海军大学校的学历和成绩。
日本海军中没有入读海军大学校，但是依靠舰队勤务等一线经历获取高位的例子并不少见。海军大将之中如加藤宽治、井出谦治（日语：井出謙治）、安保清种（日语：安保清種）、野村吉三郎；海军中将如栗田健男、木村昌福、田中赖三（日语：田中頼三）、大西泷治郎、西村祥治（日语：西村祥治）等均没有海军大学校学历，也依然位居舰队司令、军令部次长、海军次官等要职。海军少将里面，即使不考虑死后追晋的情况，这方面的例子也依然非常多（如五藤存知、城岛高次（日语：城島高次）等等）。
実松譲. 海军大学教育 戦略・戦术道场の功罪. 光人社. 1993. ISBN 4-7698-2014-3.
海上保安大学校 图书馆