吴建国（？－），中华人民共和国病毒学家。
1982年，获武汉大学微生物学学士学位。1985年，获武汉大学病毒学硕士学位，1992年，获美国爱达华大学生物化学博士学位。1993-1996年，为美国普林斯顿大学博士后。后担任武汉大学生命科学学院教授、博导、生物技术系主任，武汉大学微生物学国家重点学科带头人，“211工程”病毒学国家重点建设项目负责人、病毒学国家重点实验室主任。
