叶祖珪（1852年－1905年），字桐侯，福建闽侯人。

曾祖和祖父曾任县令，父叶汝钦为塾师，1867年，考入福建船政学堂第一期驾驶班。1871年7月毕业，船政第一期毕业，1876年冬天以“才具优异”出国留学英国，通过格林威治皇家海军学院入学考试并进入就读，次年先上“索来克伯林”号装甲战列舰实习，后又调至“芬昔勃尔”号巡洋舰，历游地中海、大西洋，"于行军布阵及一切战守之法无不谙练"。

1880年4月，叶祖珪与萨镇冰、林永昇、方伯谦留学三年期满回国，1881年授都司。1887年2月，与邓世昌、林永昇、邱宝仁等前往英、德接收致远、靖远、经远、来远四舰。1888年10月，北洋海军正式成军。1894年9月17日，中日甲午之战爆发，叶祖珪率靖远舰参加黄海海战。1895年1月20日，日军在荣成龙须岛登陆，向威海卫进犯。2月9日，中午时分，"靖远"舰中弹，祖珪被小轮船救起，送往刘公岛。甲午战败，北洋水师覆没，1895年4月17日，和邱宝仁、萨镇冰、李鼎新、林颖启被“暂时革职，听候查办”，待罪天津。

1899年4月，官复原职，加提督，1904年，擢升广东水师提督。1905年夏，感染伤寒，7月29日病逝上海。授予振威将军，葬于福州西门梅亭群鹿山之阳。