波斯尼亚战争（又称波黑战争）是指从南斯拉夫联邦独立的波斯尼亚和黑塞哥维那与多方之间的战争，持续时间为1992年4月1日至1995年12月14日。

南斯拉夫联邦解体过程中，波斯尼亚和黑塞哥维那在1992年宣布独立。

当时“波黑”（波斯尼亚和黑塞哥维那）全区约430万人口，民族的组成为33%的塞尔维亚人，17%的克罗地亚人和44%的波什尼亚克人。1992年，克罗地亚人和波什尼亚克人试图使波黑从南斯拉夫独立，而塞尔维亚人坚决反对独立。1992年4月战争爆发，时间长达3年半。战争造成约20万人死亡，200万人沦为难民。

以克罗地亚战争作为契机，想要寻求独立的克罗地亚人和波斯尼亚人同反对独立的塞尔维亚人之间的嫌隙加深。在这种情况之下1992年2月29日到3月1日之间该国进行了独立公投，因为多数的塞尔维亚人抵制投票，结果投票结果有90%以上的票赞成独立。根据此次投票，波斯尼亚和黑塞哥维那宣布独立，到4月6日并得到欧洲共同体的承认。但是对于独立表示不满的塞尔维亚人，以此事件为契机展开大规模的军事行动，翌日波黑的塞尔维亚人议会发布塞族共和国的独立宣言。

内战开始之后不久，因为先进装备的数量和部队素质使得塞尔维亚人占优势。因为波斯尼亚人装备的品质较差，军队大多也没受过完善的训练，克罗地亚人人数较少等理由居于劣势。而且波斯尼亚人和克罗地亚人并非一直都是紧密的同盟关系，所以塞尔维亚最初的攻势时就占领了全国六成的领土，并且包围首都萨拉热窝进行围城。克罗地亚人此时以守住黑塞哥维那地区西部为主，波斯尼亚人则是仅守住包含萨拉热窝、斯雷布雷尼察、哥拉谢迪、杰巴等主要都市在内三成的范围。国际社会虽有进行对于塞尔维亚的制裁和对萨拉热窝进行人道救援行动，但是尚且无法影响大局，这个情况一直持续到1992年中。

1993年春，波斯尼亚人和克罗地亚人之间产生嫌隙。而且因为克罗地亚人和塞尔维亚人所争夺的势力范围较少，加上宗教上两者都信仰广义上的基督教，克罗地亚人甚至和塞尔维亚人结盟并攻击波斯尼亚政府控制地区。而且因为争夺莫斯塔尔（波斯尼亚黑塞哥维那地区的南部中心都市），波斯尼亚人和克罗地亚人产生了激战。至此波斯尼亚人的处境更为凄惨。

这段期间，不少波斯尼亚人或到访波斯尼亚旅游的游客都是人心惶惶，因为塞尔维亚民兵公然在萨拉热窝各要道上直接以狙击枪或是投掷手榴弹攻击，因此起初国际舆论本来是观望，但经外媒报导波斯尼亚人遭遇之后，国际上大多国家开始转为对塞尔维亚为首的南斯拉夫军队挞伐，联合国、北约和部分欧洲国家的特种部队亦开始介入内战。

1994年春，由于塞军的一发120迫击炮炮弹打进萨拉热窝造成67名平民死亡，联合国安理会正式请求北约开始立即空袭。同时克罗地亚人和波斯尼亚人再度结成同盟。3月1日在华府波斯尼亚—克罗地亚方决议组成联邦。4月10日到11日之间北约小规模的对塞尔维亚方实行轰炸。8月5日塞尔维亚方攻击了联合国的武器库，因此北约开始进行轰炸，入秋之后美国对波斯尼亚—克罗地亚方也展开了的军事援助。在这样的助力下，10月下旬波斯尼亚人在席哈奇附近转为攻势，这个攻势一度成功但是在11月初就遭到塞尔维亚方的反击而不得已只好撤退。

为了支援所以11月21日和23日北约发动第三波的空袭行动，不断的空袭之下塞尔维亚方转用少数士兵轻装行动去绑架联合国维和部队士兵。因此派遣士兵的英国和法国和想要使用轰炸的美国意见纷歧，在北约无法正常运作下，美国前总统克林顿总统展开调停行动。因此从1995年1月1日起双方停战四个月。

1995年春，四个月的停战期限一过，两方再次展开激战。塞尔维亚方发动总攻击，7月时斯雷布雷尼察和杰巴被攻陷。萨拉热窝和哥拉谢迪也展开激战。此时塞尔维亚和克罗地亚方之间，塞尔维亚方因和克罗地亚军合作开始占得上风。此时的战斗已经不只在波斯尼亚黑塞哥维那，也扩大到克罗地亚境内的塞尔维亚人居住区（详见克罗地亚战争条目）。这段时间之间的6月3日为了保护联合国维和部队设立了紧急应对部队，开始展开救援被塞尔维亚方囚禁的人质。

8月28日，萨拉热窝中央市场被炮击，造成37人死亡，因为这个事件北约展开自此最大的轰炸活动，从8月30日自9月14日之间除了2日到4日之间暂时停止之外不断地攻击，造成25-27名士兵阵亡及27名平民死亡。至此塞尔维亚人也决定正式参与和平会谈。10月13日停战，波斯尼亚战争终于落幕。

1995年，波斯尼亚人的武装团体攻击塞尔维亚人居住区的布拉图纳兹，造成塞尔维亚男女老幼多人牺牲。布拉图纳兹西南方十公里处的斯雷布雷尼查当时是联合国维和部队指定的安全地区，但是北约开始轰炸塞尔维亚居住区的时候，塞尔维亚人为了对抗所以掳获了该地的联合国士兵。

7月6日，穆拉吉奇率领的塞尔维亚方为了报复波斯尼亚人对塞尔维亚人的虐杀，于是开始进军斯雷布雷尼查，11日进占市中心。12日开始塞尔维亚方将在斯雷布雷尼查居住的波斯尼亚男子全部屠杀。大批波斯尼亚妇女被强奸，还有有身孕的妇女被㓥开腹部。史称斯雷布雷尼察屠杀事件。

由此，在这两地区之间的波斯尼亚人和塞尔维亚人依旧有着无法抹灭的隔阂和心结。

当地因波斯尼亚三成分割提案等提议在摸索和平的方向，但最后是因为北大西洋公约组织对塞尔维亚方的攻击介入战事导致停战。最后各国联合调停在1995年12月签署了岱顿协定。最后的决议是让克罗地亚人和波斯尼亚人共组波斯尼亚黑塞哥维那联邦和塞尔维亚人的塞族共和国在国内并立。两国各自有着各自的主权、军队、警察及高度的分权化。

和平方案实行和民生方面则是经由上级代表事务所（英语：OHR）实行，军事方面则是由多国部队（英语：SFOR）分别担任。因为军事方面维持得尚可，于是战后的治安大致上安定。

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