核形虫是一类原生生物，具有丝状伪足,生活在土壤和淡水里。它们与同样具有丝状伪足的vampyrellid形态上非常相似，但可以通过线粒体的盘状嵴来鉴别。

核形虫与动物、真菌以及其它一些小类群同属后鞭毛生物。后续研究显示核形虫是真菌的姊妹群。2018年，Tedersoo将核形虫独立划分为核形虫界（Nucleariae），囊括核形虫门（Nuclearida）及泉生虫门（Fonticulida）。

核形虫通常很小, 最大不过50微米。