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MG149案，是2014年台北市长选举期间的争议事件。无党籍市长候选人柯文哲为国立台湾大学医学院附设医院加护病房外科主任、并担任台大医院MG149专户的计划主持人。中国国民党立委罗淑蕾质疑柯文哲在MG149之外私设账户，涉嫌贪污、洗钱、逃漏税等。对MG149账户本身，监察院审计部调查后认为“未发现违反《会计法》及该院‘学术研究支援专款管理要点’等相关规定情事”。2015年7月台北地检署将此案由他字案转为侦字案。 2016年6月8日，台北地检署侦结，认为地检署指控柯文哲涉嫌违反贪污治罪条例罪及涉犯刑法背信、诈欺取财、行使业务登载不实文书、公务员假借职务机会煽惑他人犯罪及违反商业会计法、税捐稽征法等罪嫌，均因罪嫌不足，予以不起诉处分。台北地检署依职权送台湾高检署再议，高检署认为台北地检署认事用法并无违误，7月15日驳回再议，全案不起诉处分确定。

MG149账户，全称为“外科加护病房医疗经费MG149研究专户”，是台大医院外科加护病房为支持学术研究及外科重症临床研究，依“台湾大学附设医院学术研究支援专款管理要点”，于民国八十九年八月成立“外科加护医疗经费（代号：MG149）”，接受社会人士及企业捐款。所有款项用于各项服务，包括补助贫困病患的自费项目、购置临床医疗设备等；为提升国内医师水平，该经费也长期补助补助台大年轻医师、研究生进行研究计划，且其补助不分科别。因为年轻的医师申请经费较难，研究经费常不足，过去十多年，MG149已经协助三十几位台大的年轻医师以及研究生。

MG149相关账户下，分为“公账”、“个别帐”，以及不属于MG149下但相关的“SICU私账”。此区分系因经费来源不同，区分如下：

2014年9月10日，立法委员罗淑蕾公开指控柯文哲洗钱，公然教唆、协助他人逃漏税。全案进入检方调查程序。

主要指控项目为：

柯文哲办公室发布“台大医院MG149懒人包”，对第一步指控做解释：

2014年9月13日凌晨零点5分，柯文哲在Facebook发表一则完全公开的动态时报相片上公开宣示“反抹黑、抓乌贼”。

柯文哲于竞选总部召开“光明磊落”记者会，公布：竞选经费、所得清单、财产清单、SICU私账，和夫妻两人18年的扣缴凭单纪录。 发表声明 ：

并解释，

罗淑蕾在Facebook公开“台大医院外科加护医疗经费(代号:MG149)”文件内容，指控柯文哲洗钱、贪污、伪造文书。更痛批柯文哲指使蔡璧如委托秘书刘如意管理的MG149私账中，

9月24日出刊的第696期《壹周刊》报导接获台大医院内部爆料，爆料者提出非常清晰的侧录录音档，内容为台大医院地下四楼办公室外科加护病房人员的对话，全长20分钟，只有前面几句，约52秒的时间是蔡壁如跟刘如意在讨论MG149，其他都是蔡璧如跟麻醉科医师叶育彰对话；爆料者指控此举有教唆、串供之嫌。

国税局被踢爆，于10月3日以“最速件”发文给凯达格兰基金会、三采文化、公民媒体文化协会等至少五个曾邀请柯文哲演讲或出书的团体，要求说明 2011年到2013年间，有无邀请柯文哲演讲，并提示支付相关费用的相关凭证资料，例如汇款单、扣缴凭单等，同时说明有没有捐款给台大医院，或取得台大医院的捐赠收据。公文要求在10月 9日之前提示相关资料，若不提供，可处三千元以上、三万元以下罚锾 。 凯达格兰学校执行长郑淑心昨表示，柯到校讲课次数不超过十次，且几乎不领演讲费，凯校校长张富美也说，凯校的演讲费很低，只给一千元，呼吁别为选举把黑手伸进来影响教学。前公视总经理冯贤贤，于脸书PO文说: 告诉全世界，我们协会(公民媒体文化协会)家小业小，访谈来宾只有一千元车马费，而柯P当场婉谢了。

调查台大402专户下的MG149自2007年至2014年8月的收支情形，“未发现违反《会计法》及该院（台大医院）‘学术研究支援专款管理要点’等相关规定情事。”

2014年9月24日出刊的《壹周刊》报导接获爆料，爆料者提供非常清晰的侧录录音档，内容为台大医院地下四楼办公室外科加护病房人员的对话，全长20分钟，前面52秒是蔡壁如跟刘如意在讨论MG149，其他都是蔡璧如跟麻醉科医师叶育彰对话。

2014年9月30日，国民党立委赖士葆在立法院质询审计部审计长林庆隆。林庆隆回答，台大402专户下约有400个户头，是依规定设立；其他医院也有类似做法，至于有无利益回避问题，要参考“劝募条例”。林庆隆表示，这类专户属审计部审核范围，也定期做抽查工作，台大医院开设专户，也有经过财政部同意。他指出，402专户有3种性质，包含社会救助、研究经费、及委托台大进行临床实验的费用；而该专户核报时，就有说资金来源是接受民间捐款，或研究补助经费，也会用来支援较为困苦病患的医疗费用。林庆隆在回应针对赖士葆询问台大402专户下的账户及金额多少时说，MG149账户是根据台大医院的学术研究支援专款管理要点设立，就审计部的了解，402专户下像MG149的账户约有400个，加总到去年12月31日，402专户结存10亿6700万元左右，其中8亿多是研究案、1.85亿是社会福利。赖士葆质疑，有获得限制招标的医疗厂商捐款给台大医院账户，恐有利益回避的问题。林庆隆则说，事实上其他医院也是有类似做法，像台北荣总现在还是有捐献，但有通函会依照劝募条例公开备查。

10月6日，台大医院院长黄冠棠出席立法院财政、教育联席委员会，在接受质询时，他坦承不知柯P内设MG149私规，且柯“用字确实不恰当”，台大医院不准许私设账户，他宁可相信MG149中的私账是柯自己的互助会。至于被问到柯文哲设置私账，并接受厂商捐款，有没有违法？有没有道德瑕疵？黄冠棠当场表示：“我认为是有，但这部分已经到检调，所以由检调认定这个情况。”

个别账：立委管碧玲表示，五五分帐没有问题。台湾大学的法令里头，研究专利、技术移转、产学合作，当事人是三七分帐，拿百分之七十，如果有专利的是拿百分之七十；如果没有专利的，是五五分帐。个人、发明人是拿百分之五十。

马英九透过党的秘书长曾永权下令国民党立院党团成立PK小组，协助国民党候选人议题攻防，PK小组以代理大党鞭费鸿泰主导，首波攻击锁定柯文哲的MG149争议。罗淑蕾则表示感谢党团加入，力量将会更大。

TVBS在9月15日至17日对台北市20岁以上的选民进行电话访问，相信柯文哲清白的民众有42%，不相信的民众有17%，没意见的有41%。根据三立新闻在10月2日的民调，相信柯文哲清白的民众超过5成，不信者一样停留在不到2成。

2014年9月23日，检调单位于近一周内已前后约谈了3批台大医院人员。9月25日，台北地检署以“他”字案侦讯蔡璧如。10月2日检调约谈台大ECMO组长蔡壁如、账户管理人刘如意。10月29日下午，台北地检署传讯台大医院医师吴毅晖、医务秘书刘如意和罗淑蕾的律师郭蕙兰，厘清MG149账户细节与当初使用状况，3人皆以证人身份出席。

2015年7月台北地检署将此案由他字案转为侦字案，7月28日对柯文哲以被告身份进行传唤，同一天亦传唤了罗淑蕾、蔡璧如和刘如意。8月3日传唤医药器材公司负责人和业务作证，8月4日传唤台大医院护理人员作证。 2016年6月8日，台北地检署侦结，认为柯文哲涉嫌违反贪污治罪条例罪及涉犯刑法背信、诈欺取财、行使业务登载不实文书、公务员假借职务机会煽惑他人犯罪及违反商业会计法、税捐稽征法等罪嫌，均因罪嫌不足，予以不起诉处分。 台北地检署依职权送台湾高检署再议，高检署认为台北地检署认事用法并无违误，7月15日驳回再议，全案不起诉处分确定。台湾高检署驳回的主要理由，是认为柯文哲主导账户是否违法已确实侦查，与贪污罪法律构成要件不符；柯文哲不具公务员身份、核销未违反规定，也未将钱中饱私囊，据以推论柯缺乏主观上的犯意。

MG149案使得台湾公立医院接受民间捐款问题受到关注，监察院监察委员高凤仙，对这一问题进行调查。2015年8月13日监察院通过高凤仙委员的调查报告，并对台大医院、成大医院、阳明医院、教育部及卫福部的缺失进行纠正。