巴布亚诸语言（英语：Papuan languages）是指在巴布亚新几内亚及邻近地区流通，但不属于南岛语系的多种语言的集合。由于这个语系内有多达6000多种不同的语言，而语言间的差异又很大，有不少语言学家都认为现时的分类其实未是最完善的，只是临时应用的一种分类。