性别指定疗法（英语：Intersex medical interventions）是使用手术、激素和其他医疗干预措施干预性别，以改变双性人的非典型或模糊的生殖器，主要目的是使一个人的外表更加正常，并减少未来第二性征非典型的可能性。由于有报道说手术可以危害性功能和性知觉，并且会造成终身健康问题，因此性别指定手术的历史已经引起争议。婴儿期，青春期或成人年龄的手术时机之证据，必要性和适应症与身体自主权一直存在争议。

对双性人婴儿和儿童的性别干预越来越被认为是人权问题。双性人组织和人权机构越来越质疑这种干预措施的基础和必要性。2011年，ChristianeVölling赢得了第一起针对外科医生未经同意进行手术干预性别的成功案例。2015年，欧洲理事会第一次承认双性人拥有不接受性别指定手术的权利。2015年4月，马耳他成为第一个禁止未经同意或强迫之性别指定手术的国家。

手术的目标随着性别分化障碍的类型而变化，但通常包括以下一项或多项：

身体健康理由：

心理或社会理由：

这两套基本可能目的成为辩论的主题，特别是因为手术干预的后果是终身不可逆转的。有关身体健康驳斥理由包括准确评估风险水平，必要性和时间。心理或社会驳斥理由反映了父母特别受影响于社会和文化的关切。目前尚无临床共识或明确证据表明手术时机，手术的必要性，手术干预的类型，手术干预程度和评估方法。针对社区行动组织 、国际人权健康机构、和国家伦理机构的多份报告，这种手术是重大争论的议题。

欧洲理事会强调了与性别指定手术和其他医疗有关的几个关切领域：

欧洲理事会认为，对双性人的无知和羞耻使侵犯人权的行为持续存在，对双性人的存在缺乏社会理解。 并要求尊重“双性人”不接受性别指定手术的权利。

2017年6月，美国三位前外科医生Joycelyn Elders，David Satcher和Richard Carmona在Palm Center发表了一篇论文，呼吁重新考虑对具有双性特征的儿童的早期生殖器手术。他们的声明反映了这些干预措施的历史，他们的理由和结果，指出：