山东都指挥使司，明朝十六个都指挥使司之一。

洪武元年（1368年）四月置山东等处行中书省。治济南府。洪武三年（1370年）十二月置青州都卫。治青州府。洪武八年（1375年）十月改都卫为山东都指挥使司。洪武九年（1376年）六月改山东行中书省为承宣布政使司。山东都指挥使司属于左军都督府。

青州护卫（革）、兖州护卫（革）、兖州左护卫（后为临清卫）、登州卫、青州左卫、莱州卫、宁海卫、济南卫、平山卫、德州卫（后改属后府）、乐安千户所（后改名武定，属后府）、胶州千户所、诸城千户所、滕县千户所

后来改制：