申佐（？－？），字懋良，直隶广平府永年县人，民籍，明朝政治人物。

顺天府乡试第一百四名举人。嘉靖三十五年（1556年）中式丙辰科三甲第一百一十名进士。累官陕西参议，以边功陞参政。俺答汗请求通市，申佐单骑出塞确定联盟，擢都察院佥都御史巡抚大同，因得罪张居正罢免。

曾祖申广，县主簿赠兵部员外郎；祖父申纪，寿官；父申成。嫡母魏氏；生母李氏。

有子申台吉。