欧洲联盟专门机构（英语：Agencies of the European Union）是欧洲联盟的分权机关，与欧洲联盟机构并不相同。公署的建立是为了完成某项特定目标。各公署均为法人。一些公署的成立是为了满足某些领域的科学或技术发展的需求，其他则是促进各个利益团体在欧洲及国际层级的对话。大多数机关是隶属于欧盟三大支柱。

与欧洲联盟机构不同的是，公署的建立是为了完成某项特定目标，如宣扬环境保护、运输安全和多语制度。这些机构散布欧洲各地，从都柏林到斯德哥尔摩，从华沙到里斯本，提供一般大众服务、资讯和技术。

这里将以不同颜色代表各级官所隶属的三支柱：

本文是 欧洲联盟的政治与政府 系列条目之一

执行机关是由欧洲委员会所成立，为临时性机关。