阴翼手亚目（学名：Yinpterochiroptera）为翼手目下的一个亚目，包含了以前所认知的大蝙蝠以及5个本来属于小蝙蝠的科：凹脸蝠科、鼠尾蝠科、菊头蝠科、叶鼻蝠科（英语：Hipposideridae）与假吸血蝠科。阴翼手亚目的分类基本原理来自于分子遗传资讯，而分类的结果则挑战了早期提出的大蝙蝠与小蝙蝠单系群。透过分子遗传学与生物形态学的研究分析，阳翼手亚目与阴翼手亚目的分类结果逐渐获得支持。

阴翼手亚目的学名"Yinpterochiroptera"由原先大蝙蝠的学名"Pteropodidae"以及1984年由卡尔·库普曼（Karl F. Koopman）提出的"Yinochiroptera"组合而成

研究转录组资讯的结果强烈支持了阴翼手亚目－阳翼手亚目的分类理论。研究人员也得以建构出分子钟，估计阴翼手亚目与阳翼手亚目约于六千三百万年前分家；而阴翼手亚目中的菊头蝠总科（英语：Rhinolophoidea）与狐蝠总科，则约于六千万年前分家。