巴基斯坦总理（乌尔都语：وزیر اعظم，意思是“总长” ），是巴基斯坦的政府首脑。

总理由国民大会全体议员选出，国民大会成员又是由人民投票选出的。得票最多的政党或联盟的领导人成为总理，总理负责任命及组建内阁。总统有权解除总理职务，并解散议会，以重新进行选举。第十七宪法修正案规定，最高法院拥有复核的权利，并可以否决总统的决定。

在巴基斯坦历史上，总理职位曾被撤销。1958年－1973年、1977年－1985年及1999年－2002年由于实行军事戒严令，总统拥有了总理的权利，成为了国家政府的首脑，拥有无限权力。1990年后，总理的权力有所加强。1999年10月12日，穆沙拉夫发动军事政变，自任命为首席执行官，实际执行的就是总理的职能，直至2002年。2008年穆沙拉夫下台后，恢复宪法民主体制，总理重新成为国家政府的主导性代表。

巴基斯坦政府与政治 系列条目

宪法

1999年10月12日，佩尔韦兹·穆沙拉夫推翻了纳瓦兹·谢里夫。2001年6月20日，他冠以巴基斯坦总统头衔。从1999年10月12日至2002年11月21日，他自称首席执行官。