中东呼吸综合征（英文缩写：MERS）是一种由中东呼吸综合征冠状病毒（前称“2012年新型冠状病毒”）所引起的新型人畜共患的呼吸系统传染病。患者常见的症状为发热、咳嗽、喉咙痛或胸痛、腹泻或呕吐。
疾病在2012年中东地区首次爆发，被发现于一位曾去过沙特阿拉伯的卡塔尔病患身上，他被施以呼吸道疾病的治疗，但疾病最后引起肾衰竭，入院后11天死亡。及后经过实验室分析，确认该新发现的呼吸道疾病是由冠状病毒所引起，并了解到这是以往未曾在人类身上发现过的致病病毒。中东冠状病毒和严重急性呼吸道综合征冠状病毒同隶属于冠状病毒家族；前者所导致的人类病死率比后者更高，但传染性较低。
中东呼吸系统综合征曾于2012年在中东引起大型爆发。在2015年5月，韩国首尔出现首例境外移入病例。由于该国卫生单位对此疾病不熟悉，至6月，在韩国遭到感染的患者数已经超过百例。特别引起注意的是，依照病史，少数被感染者和患者处于同一病房的时间，仅有五分钟到数小时即受到病毒感染，显示出高度传播力，此一现象引起世界卫生组织关注。现时患者分布在25国，主要流行国为沙特阿拉伯、阿拉伯联合酋长国、约旦、卡塔尔、伊朗等中东（西亚）地区和东亚的韩国。全球病例数截至2015年6月20日为止，已有1342名患者，其中有513人死亡。
当病毒发现不久，不少科学家与研究中心争相为病毒命名，并寻求专利。最早一位沙特阿拉伯科学家称呼病毒为“人类冠状病毒EMC”。随着确诊病例增加与对疾病的认知提高，更多不同的命名出现。美国疾控中心和世界卫生组织皆希望会出现一个单一名称取代无定性的“新型冠状病毒”。自该病毒分离八个多月后，国际病毒分类委员会于2013年5月15日公布了“中东呼吸综合征”这个称呼疾病的名字。虽然世界卫生组织对新命名不大满意，担心名称可能会导致区域歧视，但还是默许委员会此举。
现时仍未有一致的证据确定MERS的传播途径，可能透过接触动物、环境或确诊病人而受感染；而一般冠状病毒的传播途径，与其他呼吸道感染例如流感相似。
而美国国家过敏症和传染病研究所和沙特国王大学的研究则认为病毒来源于骆驼。
2010年至2013年间进行的一项研究，在310头单峰骆驼的身上评估MERS的发病率，揭示出MERS冠状病毒中和抗体在这些动物的血清中的力价高。进一步对沙特单峰骆驼鼻拭子上的MERS冠状病毒进行的研究测序，发现它们的序列以前与以前的人类测序隔离。从个别骆驼的身上还发现鼻咽处有一个以上的基因组变体。据报一名沙特男子给几头生病骆驼的鼻子敷药后七天发病，后来他和一只骆驼都被发现带有相同的MERS冠状病毒毒株。现在尚未明确病毒从骆驼传播给人类的方法。骆驼尿在中东地区被认为有药用价值，可以用作医治疾病。因此，有些人不听政府的防疫意见，亲吻骆驼以表蔑视。病毒学家Ron Fouchier则推测这种病毒可能源自于蝙蝠，
从中东的MERS疫情观察分析，MERS的传染力似乎较SARS为低，或许是因为相较起SARS，MERS病毒在上呼吸道的量较少之故。若MERS患者同时罹患糖尿病、肾脏疾病、肥胖症、心脏病、肺脏疾病或免疫力较差者，则会有较高的致死风险。在过去的报告曾报导孕妇感染MERS后出现胎儿死亡的案例。可惜的是，目前没有药物能够有效地治疗MERS。多数的病例都是和单峰骆驼有亲密接触而受到感染，受到MERS-CoV感染的骆驼可能不会有症状，但口鼻和脸的分泌物、奶及尿液之中仍会出现病毒颗粒。因此世界卫生组织建议不要食用未经烹煮的骆驼肉、奶及尿液。人与人之间的传染途径尚未完全证实，但目前推测可能是以飞沫传染为主。世界卫生组织建议避免接触骆驼，只吃全熟的骆驼肉，饮用巴氏法消毒过的骆驼奶，避免饮用骆驼尿。沙特农业部建议人们避免接触骆驼，或是在接触时佩戴呼吸面罩。世界卫生组织建议避免接触骆驼，只吃全熟的骆驼肉，用巴氏法杀毒的骆驼奶，避免饮用骆驼尿。骆驼尿被认为是各种中东疾病的治疗药物。沙特农业部建议人们避免接触骆驼，或是在接触时佩戴呼吸面罩。
有限的证据表明MERS冠状病毒不会在人与人间持续传播，无论是在家里或是在医院等卫生保健机构。大多数的传播发生在“密切接触医疗机构或居家危重病人的情况下”，并没有症状表明会传播给无症状感染者。群集范围从1人到26人，平均数为2.7。据韩国媒体2015年6月5日的报道，韩国首个发生MERS病例医院的门把手等处被检出病毒，空调可能是病毒传播途径。6月6日，韩国政府发言人表示，韩国的气候比中东更适合病毒生存，在病毒扩散的过程中确实有变异的可能性。
自2012年起，世界卫生组织统计大概有过千人感染MERS。其中，在追踪过往病例时发现，男性患者比女性患者多，大概每3.3名男性患者对应每一名女性患者。
现时，MERS的死亡率高达三成左右，比同属于冠状病毒引致的SARS为高，两者差约3倍之多。在2012年至2014年期间，世界卫生组织接获全球通报684宗MERS确诊病例，其中204宗死亡，而死亡率约为30%。
首个病例于2012年6月出现，而该病人有七天的发热、咳嗽、咳痰和呼吸困难的病史，并回报此前曾给饲养的带病骆驼鼻孔涂抹治疗药剂的行为。一项针对47项沙特实验室确诊病例的评估指出，患者最常见的症状为占98%发烧，其余为咳嗽（83%），呼吸困难（72%）和肌肉酸痛（32%），都是相当典型的冠状病毒感染症状。比较特别的是也有出现胃肠道症状的患者中有26%为腹泻，21%为呕吐，17%为腹痛。72%的患者需要呼吸机来改善急性呼吸衰竭的情况。病毒的潜伏期预计为5.5天（95%的信赖区间为1.9天到14.7天），此外也有患者在感染后第二天就出现症状。
MERS的并发症广泛，当中包括肺炎导致的急性呼吸窘迫综合征，也曾经出现肾衰竭、弥漫性血管内凝血和心包炎的案例。
世界卫生组织公布透过有关MERS病例定义、监测和调查、实验室指引等等。当前临时确诊病例定义是：“一个人具有阳性实验室试验的分子诊断，包括一个PCR至少两个特定的基因组的阳性反应，或者单一目标与排序的阳性反应”。
胸腔的X光影像通常可以发现肺部浸润的病征，且肺脏下半部通常会较为严重；而计算机断层成像也能观察到浸润的现象。
确诊的方式可以透过从患者的下呼吸道采集病毒，再借由聚合酶链反应(RT-PCR)确认。此外，虽然病毒颗粒曾在患者的尿液以血液中被发现，但尚不被认为是疾病确诊的方式。
现时并未有针对性治疗此病的方法，主要是支援性治疗。中国科学院已经在2013年开始研制多个MERS治疗性抗体，但均处于实验室水平，下一步将进入临床研究。台湾国立中兴大学也已经研发了抗冠状病毒药物AM1。
目前，MERS暂时没有可用的疫苗或特异预防性治疗方法。唯一的预防方式为自我预防，例如在前往农场、市场、谷仓或者有其他动物场所前，都应该采取一般的卫生措施。
按照SARS等以往的冠状病毒的经验，世卫目前建议所有与MERS疑似病例接触的人士需做以下的标准防护措施：
至于气管插管等有危险的气雾化程序，世卫建议医疗人员还需要：
由于感染的持续时间目前尚未明确，所以患者的隔离时长还不确定，但目前的建议是出现症状后的24小时内。
理论上，现有的SARS研究可以提供开发疫苗和MERS冠状病毒感染疗法的模版
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药物(抗DNA, 抗RNA, 抗逆转录, 疫苗)
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