何懋官（？－？），字希贤，浙江温州府永嘉县人，民籍，明朝政治人物、进士出身。

浙江乡试第四十六名，万历五年，会试第一百四十名，登进士第三甲第一百四十二名。万历十二年（1584年）接替陈文任崇明县知县一职，1587年由李大经接任。位于平洋沙的老县城坍塌于水后，他带领崇明县民在长沙建成了一直发展至今的新县城。

曾祖父何麒；祖父何曅；父亲何珂。母王氏。