基因组选择是指在全基因组范围内通过基因组中大量的标记信息估计出个体全基因组范围的育种值（Direct Genomic Values，DGV）并加以选择的育种方法。基因组选择方法最早于2001年由Meuwissen提出。

在实际应用中，基因组选择通常包括3个步骤：